Οι δικαιούχοι μετά την ένταξη της πράξης τους, μπορούν να υποβάλουν αίτηση πληρωμής,  αίτημα χορήγησης προκαταβολής ή αίτημα τροποποίησης. 

Η υποβολή των αιτήσεων πληρωμής, προκαταβολής και τροποποίησης πραγματοποιείται από τον δικαιούχο, μέσω του ΠΣΚΕ, μαζί με όλα τα συνημμένα δικαιολογητικά που απαιτούνται. Μετά από την ηλεκτρονική υποβολή ο δικαιούχος οφείλει να αποστείλει στην αρμόδια ΟΤΔ, υπογεγραμμένο αντίγραφο αυτής.

Η ορθή καταχώρηση και υποβολή της αίτησης πληρωμής στο ΠΣΚΕ, η πληρότητα αυτής και η εμπρόθεσμη οριστικοποίησή της είναι της αποκλειστικής ευθύνης του αιτούντα. Εφόσον η αίτηση υποβληθεί οριστικώς, λαμβάνει μοναδικό κωδικό που δίνεται από το ΠΣΚΕ και ημερομηνία οριστικοποίησης από το αντίστοιχο πληροφοριακό σύστημα, από την οποία τεκμαίρεται το εμπρόθεσμο της ηλεκτρονικής υποβολή.

Οι τροποποιήσεις ήσσονος σημασίας (εντός διακριτών τμημάτων) που δεν επηρεάζουν τα στοιχεία της πράξης όπως π.χ:, αλλαγές εξοπλισμού, τροποποίηση κωδικών ή εργασιών, κλπ και μεταφορές ποσών εντός «Κατηγοριών Δαπανών», εγκρίνονται από την  ΟΤΔ κατόπιν σχετικού αιτήματος του δικαιούχου χωρίς την υποβολή του αιτήματος στο ΠΣΚΕ.

Παρακάτω παρατίθενται συγκεντρωτικά τα σχετικά έντυπα-νομοθεσία και ο Οδηγός Επικοινωνίας και Δημοσιότητας που αφορούν στη διαδικασία πληρωμής του Μέτρου 8.3.3 «Εφαρμογή στρατηγικών τοπικής ανάπτυξης για δράσεις ιδιωτικού χαρακτήρα (Μέτρο 4.2 της πρόσκλησης) της Ενωσιακής Προτεραιότητας 4 ‘Αύξηση της Απασχόλησης και της Εδαφικής Συνοχής’ του Επιχειρησιακού Προγράμματος Αλιείας & Θάλασσας 2014-2020» (άρθρο 63, Καν. (Ε.Κ.) 508/2014)» (Β’ 5065), για παρεμβάσεις ιδιωτικού χαρακτήρα.

Τέλος, παρατίθενται και οι μακροχρόνιες υποχρεώσεις των δικαιούχων για περίοδο τριών (3) ετών από την τελική πληρωμή του.